Istraživači sa zagrebačkog Fakulteta elektrotehnike i računarstva (FER) i Genome Institute of Singapore, u suradnji s Oxford Nanopore Technologies, razvili su Herro, napredni AI alat za rekonstrukciju ljudskog genoma.
Herro omogućuje cjelovitu i precizniju obradu genetskih podataka korištenjem jedne tehnologije za čitanje dugih DNA fragmenata, čime se pojednostavljuje dosadašnji kompleksan proces integracije više različitih metoda. Rješenje značajno unaprjeđuje učinkovitost analize genoma te otvara mogućnosti za bržu primjenu u biomedicinskim istraživanjima i razvoju precizne medicine.
Rezultati su objavljeni u časopisu Nature, prestižnom i jednom od najutjecajnijih časopisa na svijetu koji objavljuje izvanredna otkrića u području biologije, fizike, medicine, kemije i drugih grana znanosti, priopćili su s FER-a. Alat Herro značajno smanjuje stopu pogrešaka u očitanjima fragmenata DNA, pritom minimizirajući brisanje stvarnih genetskih razlika između dviju kopija kromosoma naslijeđenih od roditelja.
Herro uspoređuje višestruka preklapajuća očitavanja istog mjesta u genomu, cjelokupnom genetskom materijalu organizma, i na temelju njih predviđa ispravnu bazu na svakoj poziciji. Sustav je toliko poboljšao “čitanje” DNA da sada može biti i do 100 puta točniji nego prije.
“Pokazali smo da očitanja ispravljena našom metodom omogućuju rekonstrukciju ljudskih kromosoma, uključujući zahtjevne kromosome X i Y. U tipičnim slučajevima kod ljudskih genoma, više od 30 od 46 kromosoma rekonstruirano je bez ijednog prekida”, pojašnjava Mile Šikić s FER-a. Uz Šikića, drugi hrvatski koautor u internacionalnom timu je Dominik Stanojević. Inovacijom hrvatskih znanstvenika i njihovih kolega otvoren je put potpunoj rekonstrukciji genoma uz niže troškove i jednostavniji laboratorijski postupak
